2008年馬英九獲得執政。他的勝利並不是因為在兩岸關係或國家前途上有多麼開拓的政見，而是建立在陳水扁的貪腐基礎上。
馬英九執政四年以來，兩岸關係的確有長足的進展，特別是在兩岸經貿交流與人員觀光訪問上擴大深化，但是在兩件事情上，他卻不自覺深化了“獨台”的論述。
第一件是歷史教科書事件。馬政府上台以後，在陳水扁所留下的歷史教科書課綱事上，僅有若干“撥亂”的行為，而沒有達到“反正”的目的。現有歷史課綱是1949年以前的歷史放在中國史，1949年以後的現況放在台灣史。換言之，從歷史教科書的陳述方式來看，“中華民國”已經等於台灣了。新的課綱仍然稱清朝統治下的台灣為“清領”時期，意指“清朝占領時期”，卻稱日本統治台灣為“日治時期”，意指“日本治理台灣時期”，而非站在中華民族觀點的“日據時期”。
第二件事在於馬英九政府這四年以來，對於兩岸政治定位的表述方式已經發生改變。2008年選舉以前，馬英九的政見還包括推動兩岸和平協議、建立兩岸軍事互信機制，為此，胡錦濤在2008年底也做了回應。但是到了2009年中期，馬英九的態度開始轉變了，“中華民國是個主權獨立的國家”、“台灣前途由2300萬人共同決定”、這些已經是“獨台”的言詞經常出現在馬政府團隊的口中，“先經後政”事實上卻是“只經不政”。2012年選舉以前的三個月，“兩岸和平協議”已經不再是競選的政見，而是與一般人民共同表達期望而已，不僅如此，10月19日，馬英九又為“兩岸和平協議”加了“公投同意”這個條件。
自2004年起，國民黨均反對用“公投”來於處理兩岸關係。2008年的“返聯公投”也自我詮釋為只是避免與民進黨直接在“公投”議題上交鋒所做的權宜之計，日後在投票時也的確用消極的方式讓“入聯公投”與“返聯公投”均未能通過。但是這次在還沒有討論“兩岸和平協議”應有的內容前，就將之與“公投”掛鉤，將兩者掛鉤的政治意涵就是擔心在未來和平協議的協商過程中，主權會受到人民質疑，因而先打預防針。但是這種以“公投”方式來維護主權的思維，其實就是“中華民國主權獨立”思維下的標準反應，可以看成它是“獨台”認識下的必然行為。而這種行為，又會反饋再強化“獨台”論述。
馬英九以“不統、不獨”來陳述其立場。所謂“不統”，馬英九自己的解釋是“任內不談統”，可是從文字上來看，“不統”是指“不統一”而非“不談統”。所謂“不獨”，馬英九是指“不宣佈台灣獨立”，但是馬英九卻主張“中華民國是個主權獨立的國家”，因此，所謂“不獨”並不是指不要“主權獨立”，而只是“不要台獨”。
為了讓自己的論述更為完整，在學者的建議下，馬英九從2010年底起，在“不統、不獨”的論述前又加上“在中華民國憲法下”等字眼。如果我們瞭解七次修憲後，“中華民國”的憲法已經是個幾近於“獨台”的飄浮憲法，馬英九的論述其實更趨近於“獨台下的不統、不獨”，是一種“以中華民國主權獨立在台灣為基礎的不談統與不台獨”。簡單來說，這就是“獨台”的思維。
更何況，國民黨內部對於“一中”的解釋也出現分歧，有的認為“一中”是指“一個中華”，“兩岸同屬一中”可以解釋為“兩岸同屬中華民族”，這是完全承襲李登輝的“一族兩國”論述。
更有國民黨的發言人否認“一中”。2011年11月3日，國民黨發言人陳以信即表示“馬‘總統’一向堅持中華民國主權立場，對於兩岸和平協議，他第一項保證就是要以中華民國憲法為架構；但民進黨卻硬要抹紅，硬說是為以‘一中’為前提，硬是要栽贓傾中賣台”。或許是這位發言人太年輕，或許是對憲法與兩岸關係知識有限，但是他的發言等於是否定“中華民國”憲法為一中憲法，當然還有另外一種可能，就是這些年輕的朋友，心態與認知上已經完全成為“獨台”的論述者了。
由於國民黨的領導群目前還堅持那一根讓憲法得以飄浮而沒有斷裂的細線，還主觀性的認識自己的憲法為“一中憲法”，我們因此可以用“隱性獨台”來界定國民黨的主張，所謂“隱性”就是讓“獨台”論述還蒙上一層薄紗。
民進黨可就不是這樣想了。民進黨為了取得政權，1999年發表<台灣前途決議文>，明確地說台灣是個主權獨立的國家，只是國號暫時叫“中華民國”。其實民進黨完全瞭解，一個實質上獨立的“台灣共和國”完全沒有可能，他們只能採取“借殼上市”的方法。2011年10月9日，為了再次爭取中間選票，也為自己未來選上以後，可以得到泛藍理解與大陸的接受，蔡英文喊出了“中華民國是台灣、台灣是中華民國”的新論述口號。
這樣的新論述表示民進黨已經準備接受“獨台”主張了。連民進黨以往的大老施明德先生也在其新著《常識》一書中，也認為“中華民國是台灣”是一種常識。不同於國民黨的“隱性獨台”，民進黨的“獨台”主張卻是“顯性”的，他們的“獨台”論述，沒有“一中憲法”那薄薄的一層紗，而是明確的主張“中華民國”的主權在台澎金馬。
民進黨很清楚，他們要的是“主權獨立”，如果不能用“台灣”這頂帽子，用“中華民國”也無妨。其實他們早已經願意接受“中華民國”這個國號，不然他們早可以丟棄護照，也不需競選“中華民國”名位的公職了。他們沒有一定要追求以“台灣”為名的獨立，所謂“台獨”只是一個選舉伎倆而已。
2012年的大選，在兩岸定位論述上，是一場“隱性獨台”與“顯性獨台”的競爭與匯流。無論誰贏得選舉，“主權獨立”這個概念可能會形成主流，它極有可能成為台灣未來的共識。
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