教育、健康扶貧政策未能惠及貧困人口。43個市縣由於教育、衛生、扶貧等部門工作銜接不夠、數據共享不充分等原因，導致30.4萬貧困人口（戶）未享受教育、健康扶貧政策。其中，27個市縣的1.66萬人（次）貧困家庭學生未能按規定享受國家助學金等補貼1557.38萬元；27個縣的28.74萬貧困人口（戶）未能享受新型農村合作醫療個人繳費補貼等健康扶貧政策，涉及資金6916.01萬元。此外，由於未開展村醫培訓、衛生室器械配備不足等原因，6個縣312個衛生室建成後未發揮效用。
產業扶貧政策未能有效激勵貧困戶。36個縣在產業扶貧等項目中壘大戶、簡單發錢發物等，未能有效激發貧困戶內生動力，涉及資金12.29億元。其中，9個縣將3.16億元產業扶貧等“造血”資金直接發放給貧困戶；18個縣將8.92億元扶貧資金直接投向企業、合作社或大戶，但未與貧困戶建立利益聯結機制；12個縣65家合作社、企業未按協議向貧困戶分紅等，涉及資金2094.63萬元。
金融扶貧政策未能有力制定和落實。29個縣在金融扶貧政策制定和落實方面存在制度不完善、投放不精准、貸款閑置等問題。其中，12個縣由於扶貧貸款帶動目標制定不合理、工作推進緩慢，脫貧帶動效果不顯著；10個縣7236名貧困人口（戶）未能享受扶貧貸款貼息補助等743.7萬元；7個縣用於扶貧的10.03億元貸款、政府債券、財政貼息等資金閑置。
部分扶貧項目績效不佳，有的建成後閑置或無法使用，審核驗收走形式
審計署農業司負責人表示，本次審計的重點內容還突出“績效”，即審查扶貧項目建設運營情況，重點揭露脫貧攻堅領域工作不實、扶貧審計項目績效不佳等問題。
部分扶貧項目績效不佳、管理不規範。20個市縣的47個扶貧項目由於配套設施不完善、技術支持不到位等原因建成後閑置或無法使用，涉及資金6258.09萬元。10個縣的126個項目由於前期工作不到位、項目選擇不合理等原因建成後效益不佳，涉及扶貧資金1.17億元。8個縣的10個項目由於重複實施、停工廢棄、高價採購等形成損失浪費1500.88萬元。此外，由於項目推進不力、工程質量監管不到位等原因，42個縣的1012個項目進展緩慢。
部分地方存在脫貧工作不實等問題。13個市縣對脫貧標準把握不准，或為完成脫貧任務，審核驗收走形式，1.97萬名貧困人口在住房、醫療、安全飲水無保障的情況下被確定為脫貧，20個村摘帽時飲水安全等未達標。有2個縣脫貧數字造假，虛增貧困村收入虛假脫貧，或隨意調整脫貧人數，涉及20個村、2343名貧困人口。有8個縣為完成上級對扶貧相關工作考核，存在虛報完工進度等問題。
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