兩岸統合學會是一個由台灣各界關心兩岸前途的人士所組成的民間社團。立案證書為：台內社字第0990112236號，目前理事長為台灣大學政治學系張亞中教授，秘書長為謝大寧教授、執行長為鄭旗生先生。
緣由
兩岸統合學會創始成員大多為「民主行動聯盟」的朋友，該聯盟成立於2004年，由知識份子所組成，2004-2008年間，謝大寧、張亞中、黃光國分別先後擔任總召集人。
「民主行動聯盟」自成立起，即以促進兩岸和平為職志，從2004年到2008年，台灣所有的政治性社會運動幾乎均為「民主行動聯盟」所發起，並且以導正兩岸關係之走向為目標。
這些運動包括2004年起積極反對軍購，成立「反6108軍購大聯盟」，發表宣言，由張亞中擔任總召集人，發動大遊行，創造輿論，以阻止兩岸陷入軍備競賽所可能帶來的軍事衝突。事後證明，此一運動對於當時政府的軍購案產生很大的阻礙。
2005年為反對第七次修憲，避免法理獨台入憲以及在修憲通過後小黨幾乎難有生存空間，撰寫反對修憲理由說明書與答客問，積極投入「任務型國代」的選舉，由於中選會不同意以「民主行動聯盟」為名義參與選舉。在團體姓名被剝奪的情形下，爰邀集台灣學術、社會各界學者專家菁英以「張亞中等一五○人聯盟」名義參與任務型國代選舉。由於國、民兩黨刻意冷卻選舉，外界視為「一場沒有選戰的選舉」，以致民眾不能了解該次修憲之不良後果，投票率奇低，最後功敗垂成，不過所得選票成為台灣當時第五大的政治團體。
2006年起，陳水扁貪腐行為已漸為台灣人民所不齒。6月底，民主行動聯盟在中正紀念堂前的「大中至正」廣場，舉辦「民主夜市」，呼籲全民倒扁。歷經近兩個月的努力呼喊，得到社會廣泛響應。8月起，施明德先生亦登高一呼，以一百元小額捐款，開啟了後來百萬人參與的反貪腐運動。此時起，反貪腐運動由兩條線進行，一是由施明德先生所號召的群眾聚集於總統府前廣場，另一則是民主行動聯盟所號召的群眾則聚集於中正紀念堂前廣場，彼此分進合擊，共同努力。
2007年起，陳水扁為了掩飾其貪腐行為，鞏固其權位，在外交與兩岸關係上採行激烈手段，以「入聯公投」方式動員群眾，當時在野的國民黨不敢正面否定，而採取邯鄲學步的「返聯公投」，致使兩岸關係再生緊張，2007年至2008年3月間，民主行動聯盟積推動反對「入聯公投」與「返聯公投」，終於成功瓦解民進黨操弄公投以破壞兩岸關係的圖謀。
2008年國民黨贏得大選之後，「民主行動聯盟」的主要成員，包括張亞中、黃光國、謝大寧等人，有鑑於台灣政治形勢的改變，以及兩岸局勢正面臨新階段的發展，乃決定改變組織型態，將作為社會運動組織的「民主行動聯盟」，部分轉型成為「兩岸統合學會」，希望以更具前瞻性的方式，來繼續推動促進兩岸和平發展的工作。特別是在國民黨政府或基於選舉考量、或政治理念已有鬆動，而不敢邁開大步解決兩岸核心政治問題的情形下，兩岸統合學會希望能扮演更積極的角色，來促進兩岸的認同，並規畫具體的方案，提供兩岸政府之參考。
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