長久以來，納芙蒂蒂的下落成為一個謎，甚至在法老丈夫阿蒙霍特普四世的陵墓裡也完全沒有任何與納芙蒂蒂有關的印跡。有些研究者認為，她因為失寵被法老逐出宮殿，失寵的原因可能是她一直未能生子，雖然曾生育過女兒。也有研究認為她和丈夫一起，被不能接受他們推行的宗教改革的人推翻。
但也有相當多的考古學家認為，納芙蒂蒂在夫君去世後，成為攝政，甚至擔任了法老，因此她不會被與夫君葬在一起，應該有單獨的墓葬。然而，在整個國王穀裡沒有納芙蒂蒂墓葬的任何線索。
這一次，馬姆杜·埃爾達爾率領的考古團隊宣稱，納芙蒂蒂的墓葬很可能隱藏在具有3300年歷史的埃及法老圖坦卡蒙墓室的墻後。
根據報道，該研究團隊在今年2月初提交給埃及最高文物委員會的尚未公開的報告中提出了他們最新研究成果。他們採用探地雷達對圖坦卡蒙的墓葬KV62室進行掃描時有了驚人的發現。在距離圖坦卡蒙墓室KV62僅僅幾米遠的位置，他們發現了一個神秘的空間。這個空間與KV62入口平行，高約2.13米，長約10米。目前他們還不能確定這個空間是否與KV62相通。如果不相通，那它很可能是附近另一座未被發現的陵墓的墓室。甚至有研究者認為，那可能是尚未被發現的圖坦卡蒙妻子墓葬。但是，從其與KV62形成的垂直角度看，他們更加傾向於認為兩者之間應該是相通的。他們相信，那裡就是美女王後納芙蒂蒂長眠的地方。
納芙蒂蒂是否以法老的身份下葬以及葬在何處，目前尚無人知曉，也未曾發現任何記載。位於埃及盧克索國王穀的圖坦卡蒙墓葬於1922年被兩位英國考古學家發現，他們成為3000年來首次進入該法老墓葬的人。這座墓葬也是唯一一座未被盜墓賊光顧過的法老墓葬，裡面出土的文物成為埃及古代文明最珍貴的寶藏。
曾經有DNA研究表明，圖坦卡蒙的父親確為阿蒙霍特普四世，母親卻不是納芙蒂蒂，而是他父親的一位姐妹。納芙蒂蒂是圖坦卡蒙的繼母，也是岳母，她的女兒嫁給了這位少年法老。圖坦卡蒙出生於公元前1341年，與納芙蒂蒂有機會生活在同一個時空中；他9歲登基成為法老，18歲暴斃，根本來不及修建自己的陵墓；作為法老，他的墓室小得可憐。種種理由表明，他被葬在母後納芙蒂蒂的同一座墓葬內並非絕無可能。 |
