同時，善意回應了兩岸主權沒有分裂的事實。胡錦濤曾經在紀念《告台灣同胞書》發表30周年座談會上提出進一步發展兩岸關係六點意見（簡稱胡六點講話）中強調，1949年以來，大陸和台灣儘管尚未統一，但不是中國領土和主權的分裂，而是上個世紀40年代中後期中國內戰遺留並延續的政治對立，這沒有改變大陸和台灣同屬一個中國的事實。兩岸複歸統一，不是主權和領土再造，而是結束政治對立。兩岸在事關維護一個中國框架這一原則問題上形成共同認知和一致立場，就有了構築政治互信的基石，什麼事情都好商量。
馬英九強調他的一個中國就是“中華民國”，之前他依照“中華民國”“憲法”和台灣現行的有關法律解釋了“中華民國”包含台灣地區和大陸地區的規定。因此，馬英九這次清晰的“新三不”講話，就是恪守“一個中國”，確認了兩岸主權沒有分裂的事實。
其次，馬英九“新三不”講話，也為下一階段兩岸繼續推進兩岸的制度化協商、包括兩岸兩會互設辦事處，商談文化協議，以及ECFA的後續談判所涉及的政治敏感性問題，提供有力的政治保障。
最後，馬英九“新三不”講話，為探討台灣參與國際空間助力。因為胡六點講話中還強調，對於台灣參與國際組織活動問題，在不造成“兩個中國”、“一中一台”的前提下，可以通過兩岸務實協商作出合情合理安排。這次馬英九的講話，強調他在‘“中華民國憲法”’架構下，不論在國內或國外，我們都不會推動兩個中國、一邊一國或台灣獨立。消除了大陸對台灣拓展國際空間可能造成“兩個中國、一中一台”的疑慮，為探討台灣參與國際空間創造了有力的條件，意義十分重大。
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