另外，兩岸經合會在會議結束後，雙方用自己習慣的形式，來表述會議共識，不發表共同結論，一來保持彈性，避免無謂的麻煩及困擾；二來突顯經合會只是解決問題的溝通平台，而非常設性組織，以免陷入政治爭議及政治口水的漩渦。
總之，兩岸之間協商機制具有兩岸獨有的特色，對於台灣來說，ECFA帶給台灣中小企業利大於弊是眾所皆知的，ECFA的簽署使兩岸獲得良好經濟和社會效益，包括台灣去年GDP成長；台股全年上漲9.58%；兩岸去年貿易1453.7億美元，較前一年成長36.9%，台灣對大陸貿易順差更達860.1億美元。然而在保障台灣中小企業的同時，也應該建立協調兩岸貿易和投資的相關機制，使得達到對台灣最大利益；對於短期以及中長期會受衝擊的產業，馬政府應該加強輔導和兩岸產業合作等途徑幫助台灣中小企業轉型，讓不好的影響降到最低。
同樣的情況對於大陸亦是如此，大陸當局當然亦會秉持“對大陸有利”的態度，與台灣當局進行ECFA後續談判，因此馬政府如何透過經合會與大陸充分進行良性協商談判，使台灣民眾能夠有感覺，確保台灣整體經貿利益，一來獲取民眾的支持使選舉結果不致於處於劣勢；二來能夠堅持對台灣民眾真正有利的事，對歷史負責，種種挑戰馬政府都必須謹慎處理、小心以對，稍有不慎都有可能影響年底“立委”及2012“總統”大選的結果。
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