“陸委會”而後發布四點聲明：一、政府對於有助於促進兩岸相互瞭解、符合法令規範及不影響“國家安全”的兩岸民間交流活動，向來抱持樂觀其成的態度。 二、“陸委會”參與大陸地區專業人士來台聯審機制，認為“台北會談：強化認同互信、深化和平發展研討會”相關議程等安排，屬於學術交流，申請來台與會之大陸學者尚符相關規範，亦同意學者來台與會。惟本項活動為學術性交流活動，故建議主管機關不同意具大陸解放軍身分及涉台事務人員來台參與本次研討會。三、“陸委會”推動大陸政策秉持“以台灣為主，對人民有利”的原則，充分考量兩岸整體情勢發展及台灣社會民意的脈動，既推動又把關，為台灣人民謀取最大的利益，這是“陸委會”一貫的政策立場。四、“陸委會”從未表達要求研討會主題不可出現“認同”與“互信”等文字之意見。如同主辦單位提供予媒體之大陸來台與會人員名單，相關人士於本次申請來台時，有多人未據實填報其所任機關及職稱，亦係造成本次申請案審查多有延宕的原因之一。由這四點聲明，顯然與主辦單位有一段認知上的落差。
我們可以理解馬政府的難處與苦衷，但此舉是否有開放的空間則仍不無討論的空間。事實上，學術交流活動所邀請來的應以學者為主，但學者往往亦兼任相關政府部門職務，因此若以學者單方身份限制來台是否妥適？不無討論的空間
“陸委會”與移民署此次認知與思維，並非第一次及個案處理，過去亦有不准來台的前例，其身為職權範圍內主管機關權限所為之決定，在法的角度上站的住腳，但此舉是否對整體兩岸發展的大方向不利？甚至嚴重破壞兩岸互信，讓台商及台胞利益受損，致使讓馬英九個人再度成為箭靶及怪罪的元兇，更讓人擔憂，值此兩岸經貿正需深化之際，是否因此會生變，造成兩岸人民實際的利益受損，這些都需要整體通盤考量，務求最妥當的處置。
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