在宣城市，當地農委副主任洪旭初介紹，受此輪罕見強降雨影響，全市有超過500萬只家禽死亡或被衝走，其中一部分家禽不知去向。
“今年洪水來得又猛又急，幾個養鴨場漂走了五六萬只鴨。”懷寧縣高河鎮平安村主任胡以群說，這些鴨子也不知道漂到哪去了。
無害化處理有明文規定，實際“丟的丟、埋的埋”
記者調查發現，受災各地均高度重視死亡畜禽的處理工作，對打撈、搜救出來的死亡畜禽的處理作出明確規定。以安徽為例，對砸死、淹死、病死及死因不明畜禽，要提請各級政府立即組織力量收集並採取“四不准一處理”的處置措施，即不准宰殺、不准食用、不准出售、不准轉運，對死亡畜禽必須按規範進行無害化處理。
江西修水縣征村鄉獸醫站站長鄭廣才告訴記者，陳本益家的239頭生豬被淹死後，他們第二天就組織人員對其進行深埋處理。“按照要求，死亡畜禽深埋一般需埋到2米以下，因為死豬較多，我們請挖土機挖了三個5米深的大坑才埋完。”
儘管相關部門和大部分養殖戶都表示，對死亡畜禽進行了無害化處理，但記者調查發現也存在未嚴格按照流程操作的情況。
“洪水來得太猛，我家約有2000只鴨子被淹死了。”安慶市一家禽養殖專業合作社理事長說，當時由於忙不過來，這些鴨子最後丟的丟、埋的埋，還有的裝袋丟到垃圾車上，送去焚燒發電用了。
宣城市農委負責人向記者坦陳，當前，散養戶點多面廣，監管部門沒那麼多人力、精力去監管每家每戶，出現畜禽死亡時，可能存在隨手一扔、隨手一甩等現象，很難保證全部都進行無害化處理。
一些畜牧部門幹部道出了養殖戶未進行無害化處理的“緣由”。江西省一生豬養殖大縣畜牧水產局負責人告訴記者，一頭豬幾百斤重，死了之後要深埋，養殖戶不僅要請人搬運，還要雇人、雇設備挖坑，費時費事不說，還要花不少錢，所以不如直接丟掉。
安徽省動物疫病預防與控制中心主任朱良強表示，由於死亡畜禽體內帶有大量微生物，如不及時進行無害化處理，任其腐爛發臭，病菌會到處擴散，不僅污染環境，還容易引起人畜疫病流行。
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