經過調查，金銀島一號沉船遺址共計發現石質類文物665件，皆散落分布於海床表面，大多數石質類文物表面附著有珊瑚和海洋生物。根據功用可以將金銀島一號沉船遺址發現的石質類文物分為建築構件、生活用器和船構件三類，其中以建築構件為大宗，發現647件，有石板、石條、石柱、基座、須彌座、屋面蓋板、地袱石、華拱、屋檐構件、石鬥等，部分石質類文物浮雕有精美的花紋，花紋紋樣有一瓶青蓮紋、纏枝花卉紋、綬帶紋等，生活用器共發現15件，器類較少，主要有石磨盤、石硯、石擂鉢、石杵等，船構件僅發現碇石3件。
金銀島一號沉船遺址殘存的陶瓷器多為碎片，主要發現於石質類文物之間和船板附近，2018年水下調查共計提取瓷器標本47件，以青花為主，釉色較暗，略發黑，器類有碗、盤、盞、匙等，裝飾紋樣比較單一，多見成組連續的變體壽字紋，部分碗底可見“雙泉”、“全興”等押款，另有少量的五彩、青白釉和白釉瓷器殘片。
金銀島一號沉船遺址雖然僅發現一塊原生狀態的船板，但船板附近分布有一定數量的陶瓷器碎片，且船板周圍遺址表面發現的石質類文物分布也較為密集，因此該水下遺存應為沉船遺址無疑。金銀島一號沉船遺址石質類文物的種類、造型、裝飾花紋以及青花瓷器碎片的釉色、器形、紋飾等都與珊瑚島一號沉船遺址的同類器物非常相近，尤其是裝飾連續成組變體壽字紋、器底有文字押款的青花瓷器在二處遺址皆有發現，這種青花瓷器在福建閩南地區德化、南靖、安溪等地窑址清代中晚期的遺存中也多有出土，因此金銀島一號沉船遺址的時代與珊瑚島一號沉船遺址相近，為清代中晚期，其性質應為從福建閩南地區出發為東南亞地區華人移民運輸石作和陶瓷器的船舶在金銀島附近觸礁沉沒後形成的堆積，石質類文物中的建築構件多用於建造宗廟或祠堂等。
金銀島一號沉船遺址船板的發現解決了珊瑚島一號、浪花礁二號等以石質類文物為主要堆積形式的水下文化遺存的性質，眾多水下遺物的發現也為海上絲綢之路等相關學術研究提供了新的實物資料。金銀島一號沉船遺址石柱上雕刻的一瓶青蓮花紋、青花瓷器上“全興”、“雙泉”等押款和變體壽字紋紋樣等充分體現了海外華人濃厚的鄉土觀念和對傳統文化的堅持，為研究中國傳統文化在東南亞等地的傳播和影響提供了珍貴的資料，具有重要的歷史和文化價值。
金銀島一號沉船遺址核心堆積區西北邊緣發現有碇石三塊，碇石周圍沒有發現其他相關的遺跡和遺物，但根據碇石的形狀和尺寸推測此處有可能曾有更多的沉船。
華光礁位於西沙群島永樂環礁南部，是一個隱沒於水中、發育較為完整的環礁，東西長28、南北寬8公里，低潮時部分環礁可露出海面，潟湖內水深6－32米，散布有大量暗礁，有南、北門與外海相通，南部口門大，北門較小。
2018年華光礁潟湖內水下考古探測使用了多波束測深系統、側掃聲呐、淺地層剖面儀、DGPS等設備，共計完成華光礁潟湖內掃測面積16平方千米，獲取了華光礁潟湖內的水深、海底地貌、底質模型與圖像等基礎資料，發現水下疑點多處，並對其中的2處疑點開展了潛水探摸和確認。
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