按照這一思路，浙江一手加快先進製造業基地建設，一手淘汰落後產能。
2005年，《浙江省先進製造業基地建設重點領域、關鍵技術和產品導向目錄》出台，明確了四大類先進製造業基地建設重點，即高技術產業、裝備製造業、傳統優勢產業改造提升和循環經濟；明確了36個重點領域和100項發展重點，組織實施一批帶動性強、投資規模大、技術水平高、市場前景好的重大技術改造項目。
與此同時，浙江省經貿委還抓緊調研出台《浙江省限制和淘汰製造業落後生產能力目錄》，有步驟地淘汰落後生產技術、工藝和產品，並採取有效措施加以實施，以進一步緩解資源能源約束，加快工業用地集約和置換利用。
在這一目錄裡，涉及九大行業、430項技術的傳統工業項目，被列入限制和淘汰的“黑名單”。據有關人士回憶，在當時，浙江淘汰和限制的這些“落後製造”項目，在其他許多地方仍舊是招商引資的重點，經常被列為地方經濟的支柱產業。
在習近平的直接指導和推動下，浙江在要素市場化配置改革方面展開了探索：繼2002年10月嘉興市秀洲區啟動首批廢水排污權有償使用，拉開全國排污權有償使用的序幕後，2005年1月，東陽市和義烏市的水權交易開創全國先河；同
年，對六大高能耗行業實行差別電價改革和煤電價格聯動改革，並在全國率先出台省級層面的生態補償辦法；2006年，啟動工業用地“招拍掛”改革試點……
從當年的一系列探索和實踐中不難看出，“騰籠換鳥、鳳凰涅槃”實際上是“轉方式、調結構”的一盤大棋。
2006年3月20日，浙江日報頭版發表的一篇題為《從“兩只鳥”看結構調整》的文章，首次系統闡述了“兩只鳥論”。此文後來被收入習近平所著《之江新語》一書中。
文內明確提出，推進經濟結構的戰略性調整和增長方式的根本性轉變，要養好“兩只鳥”：一個是“鳳凰涅槃”，另一個是“騰籠換鳥”。
所謂“鳳凰涅槃”，就是要拿出壯士斷腕的勇氣，擺脫對粗放型增長的依賴，大力提高自主創新能力，建設科學強省和品牌大省，以信息化帶動工業化，打造先進製造業基地，發展現代服務業，變製造為創造，變貼牌為創牌，實現產業和企業的浴火重生、脫胎換骨。
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