參加“紅旗”演習的藍軍飛行員要在演習前的數月開始准備，需要合格的低空飛行、武器操控與空中加油能力，地勤組員則需確認挑去參加“紅旗”演習的戰機連續2周不會産生重大故障。前往內利斯基地的戰機通常配置雙組飛行人員、1或2架預備機、軍需品、地勤成員、空地裝備與預備配件。所有參演單位必須自給自足，“紅旗”演習的戰爭會不顧維修保障能力而持續下去，藍軍的參演單位必須要確保自己的作戰能力不致中斷。
周而複始的“紅旗”演習，讓內利斯基地的設施持續不斷地承受約100架戰機和5000名人員作業。
參演部隊會在演習開始前的周末就抵達內利斯基地幷接受包含基地方位、離到場程序與飛行限制等一般性簡報，空勤組員將進行前10架次的作戰任務熟悉飛行。
第一天的任務通常是熟悉性任務，空勤組員在內利斯基地的訓練空域中以150米或稍高的高度飛行。這些空中任務中或許會包含投擲炸彈，但此時還不會有與紅軍戰機的空中遭遇。熟悉日的任務是“紅旗”演習中最輕松的，隨著演習日程的推進，任務的難度與挑戰性則與日俱增。任務逐漸變爲攻擊各種目標靶、反恐打擊、獵殺彈道導彈發射車或是支援地面部隊等。在進行戰鬥搜救任務中，會有一名飛行員某日“遭到敵方擊落”，藍軍在接受命令後要計劃幷執行戰鬥搜救任務。
“紅旗”的任務在414中隊前一天對參演單位下達空中任務指令後開始計劃，空中任務指令包含任務所有細節，如任務目標、防衛情報、進出目標航綫、天氣預報與通信頻率等。每天都有新的任務與科目，如低空飛行、實彈與空中加油科目，與此同日寸來自空中與地面抵抗强度越來越大、任務也愈發複雜。
任務指揮官每日皆由藍軍中遴選一名資深飛行員擔任，藍軍分別爲許多分隊分配不同的目標或打擊任務。任務指揮官需制定較安全或容易反制敵防空系統的飛行路徑，幷利于達成任務。在一天的任務中，紅軍與藍軍的飛行員～起接受總提示，報告當日天氣與安全注意事項。接著藍軍飛行員就各自進行分組提示，同時地勤組員已經開始准備戰機。在下午的任務之前，地勤與機務人員已經忙了一個上午。作戰般的節奏讓參演的空、地勤組員接受如實戰般的洗禮。
戰役進行
所有“紅旗”演習的空中任務都在內華達測試與訓練空域進行，空域形狀看似倒三角形，而內利斯基地與拉斯韋加斯則在南方三角形端上。內華達測試訓練空域包括內部機密區域在內總面積達13000平方千米，“紅旗”演習也會由內華達測訓空域的北方與東方，延伸進八猶他州的軍事區進行。
藍軍機群由內利斯基地起飛後就在東邊集結出發執行任務。戰機經過空中加油，便轉往西方內利斯測訓區計劃的空域與高度執行打擊任務。紅軍戰機此時由西方進入接戰空域幷進行防禦任務，而在命中目標後藍軍戰機可能掉頭由東邊脫離、或～直由西邊離開演習區域。這里的山區地形可供攻守雙方作爲攻擊與防禦之用，進行極具挑戰性的超低空飛行。
紅軍則利用地面防空系統與空中戰機保衛“祖國”，而防禦仿真器包含固定與移動發射源，幷且逐日變換防禦陣地。仿真器包括地列空導彈雷達發射源、防空導彈發烟仿真器以仿真防空導彈發射。藍軍戰機在數量上往往壓倒紅軍戰機，爲彌補紅軍劣勢，紅軍戰機在遭“擊落”後可以繼續接戰。但藍軍遭紅軍擊落後就必須立即退出戰場，由靶區西邊返航，紅軍也擁有空中加油機，故紅軍戰機可以全程伺候藍軍的打擊任務。但爲安全起見在藍軍戰機接近地面打擊目標5英里內，紅軍戰機就脫離戰鬥。
內利斯訓練區內包含超過50個真實目標，包括全尺寸幷停放退役戰機的機場、防空導彈陣地、卡車車隊與裝甲戰車、碉堡與建築物模型，另外如火車或彈道導彈發射車則是機動的。“紅旗”演習允許參演者以實彈攻擊部分目標。剛開始的任務以藍色練習彈代替，但後面的任務多可利用實彈。對許多飛行員而言，“紅旗”演習是他們第一次使用實彈飛行與作戰。
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