此外，充分利用自己的資金、技術優勢，向有關國家提供援助，也是日本將勢力滲透到馬六甲海峽的一種重要手段。2004年年底，印度洋發生地震海嘯，給沿岸各國帶來了巨大的災難，美軍派出了1.3萬人的兵力參加救災，日本也派出了1000名自衛隊隊員進入海嘯災區，並調遣兩艘戰艦開到了印度尼西亞的亞齊附近海域游弋。2005年1月9日，印尼國防部長尤沃諾同日本防衛廳長官大野功統會談時委婉地下了“逐客令”，他說：“駐扎外國軍隊是一個很微妙的問題……目前的活動期限是三個月……如果延長時間，則必須得到印尼政府的同意。”印尼下達“逐客令”，是對美、日等國企圖借機常駐附近海域，染指馬六甲海峽，干涉周邊國家事務的憂慮。
2005年4月28日，日本、泰國、柬埔寨和新加坡簽署了《在亞洲對付海盜及持械搶劫船只案區域合作協定》，其內容之一就是建立信息共享中心，全天候提供最新的海上信息，日本提供大部分運行費用。日本借助信息中心，實時監控馬六甲海峽。除政府撥款外，日本財團也對維護馬六甲海峽安全提供了援助，如2009年，日本財團提供250萬美元作為維護海峽安全的預算費用。
日本依靠其科技實力，開發出了一種叫“虎之門”的警報器，它可以在海盜登船之前發出警報，不久，日本又開發出“海上劫持警報與船舶追蹤系統”，它每天6次發送信號，報告船只的具體情況，若船只被劫，它會通過電子郵件和移動電話及時發出警示。這些對付海盜的預警系統，引起了東南亞國家的興趣。日本試圖通過技術援助，參與馬六甲海峽事務。日本通過游說，已部分達到了目的。2004年12月9日，新加坡國防部長張志賢與印尼總統蘇西洛舉行會談。雙方在馬六甲海峽安全問題上達成新意向：歡迎日本等國家提供援助。這是新馬印三國在馬六甲海峽實施聯合巡邏以來，首次明確表示要接受某一國的援助，這一動向必須引起高度的重視。
馬六甲海峽是大國全球博弈熱點中的熱點。要在這裡的競逐中脫穎而出，沒有一支強大的海軍作為後盾是不可能的。這一點認識，就曾是亞洲和西太平洋地區的海上強國的日本來說，是十分深刻的。在第二次世界大戰戰敗後僅僅二十餘年裡，在美國的扶植和支持下，日本又迅速建立起了一支強大的海上自衛隊，其實際作戰能力，只位居美國、英國之後，列世界第三位，遠遠超出了維護本土安全和保障海上運輸線暢通的要求，具有明顯的攻擊性，成為威脅亞太地區安全與穩定的新的隱患。
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