水下情況更糟糕；通常，美國航母有一些看不到的同伴伴航，至少是一艘核動力攻擊潛艇。潛艇的任務就是在航母前面巡邏，搜尋敵軍軍艦，尤其是其它國家的潛艇。畢竟，潛艇是世界上最致命的軍艦殺手。
解放軍海軍擁有兩艘能夠進行遠程巡邏的093型潛艇。同樣的，除了其他分配給中國攻擊潛艇部隊的任務，那遠遠不夠護衛航母的職責。為了協調水面軍艦和潛艇，美國和其它國家的先進海軍依靠混合使用安裝在特殊飛機上的低頻波段，以及軍艦向潛艇傳送的高頻波段。
但中國還沒有完善那樣的系統。賈斯-赫克勒(Garth Heckler)、艾德-弗朗西斯(Ed Francis)和詹姆斯-穆爾維農(James Mulvenon)在2007年著作的《中國的未來核潛艇》(China’s Future Nuclear Submarine Force)一書中寫道：“由於核潛艇通信技術的限制，人民解放軍海軍目前只能演練用相對受限的戰術控制自己的潛艇。”
因為這個原因，“施琅”號或許不能依靠中國潛艇保護其不受別國潛艇的攻擊。這個現實引起了國家戰爭學院教授伯納德-科爾(Bernard Cole)一針見血的評論，他表示：“作為一個前海軍人員，我當然希望看到中國建造的航母艦隊只是潛艇的靶子。”
“波將金”航母
不考慮其與美國航母相比一般的體積，未完成的艦載機和護衛力量，以及沒有其它航母一起航行的事實，與其具有攻擊性的外形相比，“施琅”號可能不那麼有威脅；而它最大的潛在弱點是艦體內部由烏克蘭提供的發動機。
動力裝置——即飛機的噴氣式發動機、艦船的渦輪發動機，是任何武器系統最為複雜、最昂貴和最麻煩的部分。問問五角大樓F-35隱形戰機和美海軍聖安東尼級兩栖艦的設計師就能明白這個道理，這兩者都差點因為發動機難題宣告失敗。
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