美國海軍重返蘇比克灣的主要戰略目的有三個：
首先，蘇比克灣面向南中國海的腹地，是控制東南亞周邊海域、遏制大國海軍活動的最佳地點，也是美國打造的第一島鏈的重要一環。如果能夠實現駐軍計劃，不但可以填補美國在這一海域的力量空白，也必將遏制戰略對手的海上力量發展。
第二，菲律賓同中國在黃岩島等島礁問題上的爭議日趨緊張，此時美國打出保護菲律賓所謂的“國家安全”和“合法利益”的幌子，意在拉攏阿基諾政府和菲律賓民眾，為美國重返亞太的總體戰略目標服務，進而達成菲律賓政府與美國軍事力量的全面合作。
第三，東盟各國軍事實力薄弱，它們既希望能借助美國強大的海空軍力實現地區力量平衡，又不希望美國長期駐軍使本國內政外交受制於人。因此東盟各國對美國的軍事存在懷有戒心。此次美菲在蘇比克灣執行“半永久性”駐軍計劃，以保護領土、領海利益為誘餌，意圖在東盟內部實現“漣漪”效應，推動其他東盟國家盡快投入美國設立的軍事保護傘內，最終實現在東南亞地區建立以美國為首的軍事聯盟體系。
但從目前來看，美軍距在菲律賓蘇比克灣實現全面駐軍的目標還相去甚遠，雙方將繼續延續聯合軍事演習和聯合訓練等軍事合作方式。
這其中的原因是，美國在蘇比克灣實施軍事部署的目的與菲律賓對美國的期待值不一致。菲律賓希望通過美軍的介入來增強其在爭議島礁的軍事實力，迫使中國在南中國海領土爭端中做出讓步。而美國軍事存在的主要目的在於炫耀武力，限制中國海上力量的活動空間。也就是說，美國不會為菲律賓的海島之爭強出頭。
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