對於這樣司法不公背後的瀆職犯罪案件，各級檢察機關也“毫不手軟”，在專項工作期間，共查辦徇私枉法案363件425人，查辦民事行政審判枉法裁判案87件98人，查辦執行判決、裁定失職案18件19人，查辦執行判決、裁定濫用職權案14件15人。
專項工作期間還集中查辦稅務人員徇私舞弊，濫用職權，給國家造成巨額稅款流失的瀆職犯罪案件，共立案偵查涉嫌瀆職犯罪的稅務人員438人。
不法分子鑽制度缺陷的漏洞，或以商業賄賂等手段導致主管機關工作人員徇私枉法、玩忽職守，造成國家巨大經濟損失的瀆職犯罪案件也“難逃法網”，各地檢察機關針對發生在產權交易過程的瀆職犯罪案件也加大了查處力度。
此外，各地還集中查辦了一批社會保障機制運行中的瀆職犯罪大案要案。如湖南省人民檢察院查辦了婁底市原常務副市長、住房公積金管委會主任易佑德濫用職權，違規決定將8200萬元住房公積金委托不具備委托投資管理資質的公司進行國債投資管理，造成資金全部損失的案件；山東曲阜市檢察院查辦了曲阜市勞動和社會保障局農村養老保險處原主任陶憲友濫用職權，擅自將農保基金3292．3萬元用於國債質押式回購套作，造成2659萬元損失的案件；四川成都市檢察院查辦了成都市住房改革資金管理中心原主任楊燦智等人濫用職權，擅自動用2億餘元住房公積金購買國債，造成資金全部損失的案件。 |
