溫家寶指出，深化科技體制改革的中心任務，是解決科技與經濟結合問題，推動企業成為技術創新主體，增強企業創新能力。這是一項事關國家長遠發展的基礎性、全局性、戰略性重大任務。企業強則國家強。我國是製造業大國，已經具備很強的製造能力，但仍然不是製造業強國，總體上還處於國際分工和產業鏈的中低端，根本原因就是企業創新能力不強。如果能在“中國製造”前面再加上“中國設計”、“中國創造”，我國的經濟和產業格局就會發生根本性變化。企業的創新能力，很大程度上決定我國經濟的發展前景。
溫家寶對增強企業創新能力提出了具體要求。一要支持企業建設高水準研發中心。真正的企業研發中心，是企業創新能力的源泉、企業競爭力的核心，應當具備足夠能力把握創新機會，選擇創新方向和技術路線，組織技術研發、產品創新、利用和轉化科技成果。“十二五”時期，國家重點建設的工程技術研究中心和實驗室，要優先在具備條件的行業骨幹企業佈局。二要以企業為主導深化產學研結合。企業直接參與市場競爭，對新技術、新產品最敏感。產學研結合，要堅持“產”為主導，即企業為主導。國家重大科技項目，凡是產業目標明確的，要由有條件的企業牽頭組織實施。三要建立科技資源開放共享機制。國家投資建設的科研設施要向企業開放，作為技術研發的公共平台。國家支持的科研活動所獲得的信息資料，要最大限度地向社會公開。四要創造公平開放的市場環境，使各類企業公平獲得創新資源。科技型中小企業最具創新活力，要為他們發展創造更有利的條件。大力支持企業開展國際科技交流合作。加強知識產權保護，建設規範的知識產權市場。
溫家寶強調，要在政策上最大限度地支持企業創新，要抓好現有政策的貫徹落實，並進一步完善，重點解決政策之間的協調性問題，增強政策的針對性和實效性。要建立健全財政性科技投入穩定增長機制，完善財政資助、貼息和稅收減免政策，鼓勵和支持企業增加研發投入。引導金融機構綜合運用買方信貸、賣方信貸、融資租賃等方式，加大對科技型中小企業的信貸支持。充分發揮資本市場支持科技型中小企業創新創業的重要作用。完善產業技術政策，支持企業採用新技術、新工藝。適應科技與產業融合發展的趨勢，改進高新技術企業認定辦法。改革科研機構、高等院校人事管理制度，建立開放、競爭、流動的用人機制。鼓勵科技人員在企業與科研院所、高等院校之間雙向兼職和流動，支持他們創新創業，特別是創辦科技型中小企業。健全技術要素參與分配的機制，健全與崗位責任、工作業績、實際貢獻緊密聯繫的激勵機制，使科技人員的創造性勞動獲得與其價值相稱的收入，得到社會的認可和尊重。
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