高育仁認為，目前台灣政府當局所強調的：兩岸“互不承認主權”、“互不否認治權”的主張，仍無法排除兩岸進一步作政治協商或做出合情合理政治安排的障礙。我們是否可拋棄私心、成見，為中華民族和兩岸人民利益著想，兩岸均以百年的“共同史觀”為主軸，重新研討進行完整的歷史論述，並以兩岸“互相承認重迭的主權”、“互相尊重分立的治權”，以及“一中兩憲”、“一中兩府”等原則來探索兩岸未來合情合理的政治安排。
他提到，兩岸過去六十多年間，曾在國際上進行了劇烈的爭奪。兩岸政府曾經先後單獨在聯合國代表雙方，單獨擁有“中國”代表權，包括安全理事會常任理事國的席位。從1949年到1972年20多年間，是由台灣的“中華民國政府”作為中國代表從1972年至今40多年，是由大陸的“中華人民共和國政府”作為中國代表，兩岸政府在國際上重迭複雜的情況可見一般。
然而無可諱言的，台灣自1972年退出聯合國後，在國際社會上逐漸陷於孤立，無法在國際組織或國際關係上獲得適當的對待和參與。台灣人民的失望和不滿以及對參與國際活動的期望，應可瞭解。雖從2008年之後，兩岸以“外交休兵”作為兩岸和平發展的外交準則，兩岸也的確逐漸較少在涉外事務上的衝突和內耗。但兩岸未來政治上的“合情合理安排”，除兩岸在認同互信基礎上，以平等互惠原則處理兩岸相關事項外，應包括台灣參與國際組織和國際活動，以及台灣與世界各國平等適當的關係等，這都是需要兩岸專家學者深思熟慮去探討。
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