完成篩選後，研究人員決定使用他們的新數據集來檢查一些生物學問題。最明顯的應用是首先研究具有未知功能的基因。
由於新測序讀出了許多已知基因的表型，研究人員可使用這些數據將未知基因與已知基因進行比較，並尋找相似的轉錄結果，這可能表明基因產物會作為更大復合體的一部分協同工作。
一個名為C7orf26的基因的突變尤為突出。研究人員注意到，去除導致相似表型的基因是稱為整合子的蛋白質復合體的一部分，該復合物在產生小核RNA中發揮作用。整合子復合體由許多較小的亞基組成，之前的研究表明有14種單獨的蛋白質，研究人員此次證實C7orf26是復合體的第15個組成部分。
他們還發現15個子單元在更小的模塊中協同工作，以在整合子復合體中執行特定功能。
篩選正確分離DNA的因子
Perturb－seq的另一個好處是，由於該分析側重於單細胞，研究人員可使用這些數據來查看更復雜的表型，這些表型在與來自其他細胞的數據一起研究時通常會變得混亂。
研究人員發現，導致細胞間不同結果的基因子集是染色體分離的原因。這種分離會導致細胞丟失一條染色體或獲得一條額外的染色體，這種情況稱為非整倍性。
韋斯曼表示：“你無法預測失去這個基因的轉錄反應是什麼，因為它取決於你獲得或失去的染色體的次要效應。我們意識到，這個局面其實是可以扭轉的，創造這種復合表型，尋找獲得或丟失的染色體特徵。通過這種方式，我們對正確分離DNA所需的因子進行了第一次全基因組篩選。” |
