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國際首創的活細胞轉錄組測序技術
http://www.CRNTT.com   2022-08-24 19:18:32


 

  對此,審稿人在評審意見中也寫道:“由於細胞測序後仍舊存活,活細胞轉錄組測序技術首次實現了對同一個細胞全基因表達的連續測量。”

  細胞測序結果從“高清圖片”到“高清電影”

  在細胞觀測技術史上,顯微成像和基因編輯介導的分子記錄等技術不僅能觀察細胞的生長、分裂、死亡等過程,還能觀測細胞中的單個或幾個基因指標。

  2009年,單細胞轉錄組測序技術為更系統全面地定義細胞類型和狀態提供了變革性手段。但人們仍然只能觀察到細胞的靜態狀態,無法連續觀測細胞的動態或者檢查細胞後續的表型。

  如果將利用單細胞轉錄組測序技術觀測細胞,比喻為看一張細胞在分子水平的高清圖片,那麼利用活細胞轉錄組測序技術觀測細胞,就好比看一部細胞的高清電影,能夠看見它的“前世今生”。

  “活細胞轉錄組測序技術可以回答細胞怎樣的過去決定了它的現在,不僅知道細胞為何存在差異,還知道這些差異從何而來。”陳萬澤介紹。

  在驗證實驗中,研究團隊利用活細胞轉錄組測序技術直接測定了同一個巨噬細胞在不同時間的狀態變化,發現細胞起始狀態的少數基因的表達差異和噪音(如Nfkbia、Gsn等)是決定細胞後續反應差異的重要原因。然而,普通的單細胞轉錄組測序技術無法找到這些規律。

  陳萬澤表示,儘管活細胞轉錄組測序技術仍然存在諸多挑戰,需要進一步完善,比如低通量、暫不能在體內應用、在高度極化且mRNA分布不均的細胞中無法實現全細胞轉錄組測序、對細胞更多次的采樣還需進一步研究等,但該技術首次實現了活細胞連續觀測,也為單細胞測序技術發展帶來了更多可能性。未來,團隊將進一步進行深入研究,提高活細胞轉錄組測序技術的可用性。


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