值得關注的是，由於市場的風險性，科研創新、成果轉化的不確定性，企業、高校和科研院所之間的信息不對稱和不完全，這些導致了企業真正的科研投入必然小於潛在最優科研投入，進而產學研的融合程度也必然小於最優融合程度。立足中國基本經濟制度，發揮我國企業的主體多元性優勢，可以破解這一普遍難題。要充分調動國有企業在產學研過程中的中流砥柱作用，也要發揮民營企業作用，多層次整合創新資源。央企要加強對基礎研究、非對稱技術的科研投入，國企要加強對應用研究、關鍵技術的科研投入，中小微企業則可以側重試驗開發等環節的科研投入。由此，發揮不同企業主體在產學研過程中的比較優勢，與相應的高校及科研院所更加密切合作。
企業主導的產學研深度融合，並不是單方面強調企業的主體地位、主導作用，而是在符合科技創新規律的基礎上，推動強強聯合、協同攻關。既要吹響企業主導的衝鋒號，又要吹響企業、高校和科研院所之間緊密結合的集結號，集中優質科研和產業資源，推動核心技術研發、孵化和成果轉化，形成高水平的產學研一體化。進而推動創新鏈、產業鏈、資金鏈之間的有機結合和相互支撐，實現知識、資本、人才、商品和信息的最優組合。要擺脫優質企業之間的局部利益，強化企業間合作；要組建綜合集成的國家實驗室，促進高校、科研院所之間的協同攻關。更好推進企業、高校和科研院所之間廣義的協同，形成具有中國特色的產學研聯盟。
總之，科技創新需要系統思維，全方位推動企業主導的產學研深度融合，必須要結合中國實際，以國家戰略力量為引領，以聚焦產業體系升級為主線，以激發市場主導作用為關鍵，注重宏觀、中觀和微觀協同推進，不斷提升產學研融合深度，全面提升我國科技創新水平，形成國際競爭新優勢 |
