分布 在意大利、西班牙、希臘等地
自2004年起，美軍將第六艦隊司令部從加埃塔移駐英國倫敦，和美國歐洲海軍司令部合併，但在意大利那不勒斯組建美國海軍歐洲-非洲指揮所，同時，第六艦隊旗艦——兩栖指揮艦“惠特尼山”號留駐加埃塔。
第六艦隊的日常編制，包括第60、61、62、63、64、67、68、66/69特遣部隊。其中第60特遣部隊系水面作戰主力，一般包括一個或多個航母編隊，每個航母編隊有6艘左右巡洋艦/驅逐艦護航，並搭載65架至85架各種戰機和直升機。第61特遣部隊為兩栖艦艇編隊，包括3艘大型兩栖戰艦和搭載的小型登陸艇。
第62特遣部隊屬於海軍陸戰隊，也稱海軍陸戰隊第62遠征部隊（旅），擁有陸戰隊士兵1800人，登陸艇61艘。第67特遣部隊為陸基巡邏飛機部隊，主要擔負在地中海海域的反潛、偵察、監視等任務；第66/69特遣部隊其實是同一支編隊的不同番號，系反潛編隊，主要使命是使用攻擊性核潛艇等反潛裝備，攻擊敵方潛艇和水面艦艇。
第六艦隊在地中海的主要基地，包括意大利那不勒斯、加埃塔、的裡雅斯特、西格內拉，西班牙羅塔，希臘克里特島的蘇達灣等。如果有需要，第六艦隊編制下會出現以“第50×”為編號的特遣編隊，其中502為航母特混編隊，503為兩栖艦艇編隊，504為特遣陸戰隊，505為後勤部隊，506為特種部隊。
第六艦隊的許多艦艇並不固定編成，而是在大西洋艦隊管轄下統籌調配，自2010年起，平時約保持艦艇40艘，飛機和直升機175架，海軍和陸戰隊官兵2.1萬人的編制。
戰備：最先進航母戰機 能攻能守
特色：裝備有先進的電子戰飛機
第六艦隊在多次執行警戒、威懾、實戰任務中表現不凡。其中，尼米茲級“布什”號航母是目前美國最先進的航母。
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