國防大學軍隊政治工作教研室副主任公方彬大校曾對記者解釋說，軍隊的紀檢系統與地方有區別。目前，各級軍紀委的辦事機關都在政治部門。在主管軍紀委的副政委之上，還有相應的軍事、政治兩個主官。
孫飛也解釋說，中央軍委紀委的日常工作由總政下面的二級部總政紀檢部承擔。各總部、大軍區、大單位，集團軍、省軍區、軍級單位等部門的紀委，日常工作由政治部(處)下面的紀檢部(處、科)承擔。
不同之處2：級別規格
中央軍委紀委書記由總政治部副主任兼任
“政事兒”(微信ID：gcxxjgzh)注意到，改革開放以來，歷任中紀委書記絕大多數都是中央政治局常委，地方各級紀委，例如省級紀委，紀委書記也是省委常委班子成員。
而中央軍委紀委書記，一般由總政治部一名副主任兼任。從2002年開始，中央軍委紀委書記一般都還由中紀委副書記兼任。例如，十八屆中央紀委副書記、解放軍總政治部副主任杜金才兼中央軍委紀委書記。
至於各總部、大軍區、大單位，集團軍、省軍區、軍級單位等部門的紀委，紀委書記都由一名副政委擔任。
有媒體報道稱：軍紀委書記由解放軍總政治部副主任兼任，并由總政領導，而總政治部是軍委委員級別，所以中央軍委紀委的級別應該要低一級，是正大軍區級。
不同之處3：產生方式
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