台灣問題今後仍是存在於中日之間的焦點問題之一，台日關係今後仍然是一對不規則的雙邊關係與日本介入台海事務的具體“抓手”。自2016年5月民進黨再次執政以來，在台日“合力抗中”目標下的雙邊互動中，日本始終居於主導區位，其自身獲益和回旋餘地明顯高於台灣。隨著2020年9月安倍辭職與安倍色彩濃厚的菅義偉內閣成立，後安倍時代台日關係走勢又呈懸念。
2020年1月11日，蔡英文再次當選台灣地區領導人，當天，日本外務大臣茂木敏充表示祝賀。1月 12日，自民黨國會議員岸信夫、日台交流協會會長大橋光夫等多位日本政客赴台祝賀。1月17日，“日（華）台議員懇談會”會長古屋圭司在台北對蔡英文呈遞時任首相安倍晉三以自民黨總裁身分的親筆賀函，恭喜蔡英文連任。
1月20日，時任首相安倍在國會施政演說中談及東京奧運會時表示，日本政府把今年奧運會定位為“復興奧運”，有許多城市將分別接待各地好手，其中岩手縣野田村是“台灣接待城”。台灣“外交部”迅速回應稱，樂見台日關係正面發展，預祝東京奧運會圓滿成功。《日本產經新聞》稱，與日本沒有“邦交”的“台灣”一詞在首相的施政演說被提及，實屬罕見。上一次是2006年1月20日，時任日本首相小泉純一郎在施政方針演說時舉例說明前一年訪日外籍旅客增加的要因，稱是因為對台灣實施免簽措施。報道分析認為，安倍此舉是對中國的一種牽制。
2020年5月19日，日本外務大臣茂木敏充在內閣會議上提交2020年版《外交藍皮書》，將台灣從“重要夥伴”的定位提升為“極為重要的夥伴”，而且較2019年版約增加1頁左右的對台灣問題的描述。《藍皮書》自2017年以來首次稱“一貫支持台灣以觀察員身份參加世界衛生大會（WHA）”。
5月 20日，時任日本官房長官菅義偉祝賀蔡英文第二次就任台灣地區領導人。由於受疫情影響不克赴台參加蔡英文就職典禮，岸信夫率領“日（華）台議員懇談會”事先錄影向蔡英文表達祝賀。
毋庸置疑，安倍執政的近八年期間台日關係保持著“暖升”態勢，有日本學者指出，自1972年台日“斷交”以來，“安倍政府是對台灣最友好的政府”。如安倍在任期間與蔡英文持續保持台日首腦之間“推特對話”。如安倍30日宣布辭職後，8月31日蔡英文就在推特上對安倍大加讚賞，稱他為台日關係“貢獻”巨大。安倍隨即推文回應稱，感謝台灣朋友的溫情問候，期待日台合作與交流更加深化與進步。
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