現在，新賽季的CUBA聯賽也將迎來史上重大的一次賽制改革：實行主客場制。首批計劃實行基層賽主客場的省（區、市）有14個：北京、天津、吉林、黑龍江、上海、江蘇、福建、山西、陝西、河南、四川、湖北、湖南、重慶。
“全美籃球聯賽第一級聯賽裡350多所學校，會在賽季初全部進行主客場常規賽，因為主客場制可以吸引更多學校參與和更多觀眾的關注。”阿里體育副總裁魏全民說，“CUBA之前都是賽會制，可能承辦學校所付出的精力和資源更多，但是有主客場制的引進和改良、優化，我相信CUBA就會真正成為每所大學自己的比賽。”
改革還不止這些。僅以CUBA一級聯賽為例，基層賽過後，四個賽區將直接產生24支進軍全國32強決賽的球隊，剩下的8個名額，將由四個賽區710名球隊，進行落選賽的比賽。32強將採取雙敗淘汰制，直至精英八強。精英八強則通過主客場，產生最後的巔峰四強。最後的巔峰四強，賽制則是單敗淘汰制。
中國大學生體育協會副主席張磊說：“但是CUBA實行單敗淘汰，可能還不是很現實，因為我們大學球隊之間的實力，不像美國大學那樣均衡，所以雙敗淘汰，給了實力稍差的學校更多比賽的機會，也給了實力稍強的球隊一定程度的容錯率。”
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