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表達基因的首份綜合功能圖譜發布
http://www.CRNTT.com   2022-06-11 14:43:05


  中評社北京6月11日電/據科技日報報導,人類基因組計劃完成20多年後,美國懷特黑德研究所喬納森·韋斯曼及其同事展示了在人類細胞中表達基因的第一份綜合功能圖譜。9日在線發表於《細胞》雜誌上的項目數據,將每個基因與其在細胞中的功能聯繫起來,這是多年來基於單細胞測序方法Perturb-seq的重大合作研究成果。數據可在韋斯曼實驗室網站上獲得,供其他科學家使用。

  兼任麻省理工學院生物學教授和霍華德休斯醫學研究所研究員的韋斯曼說:“有了這張基因型—表型關係圖譜,你可以進入並篩選數據庫而無需進行任何實驗。”

  數據可在韋斯曼實驗室網站上獲得,供其他科學家使用。藝術圖喻示一個人進入基因功能圖譜數據庫。

  該圖譜使研究人員能深入研究各種生物學問題。研究人員可用它來探索功能未知的基因對細胞的影響,研究線粒體對壓力的反應,並篩選導致染色體丟失或獲得的基因,這種表型在過去被證明是難以研究的。

  借助CRISPR構建圖譜

  該項目利用的Perturb-seq方法,能以前所未有的深度跟蹤基因打開或關閉時產生的影響。Perturb-seq方法使用CRISPR/Cas9技術將基因變化引入細胞,然後使用單細胞RNA測序來捕獲變化引起的表達RNA信息。由於RNA控制細胞行為的所有方面,這種方法可幫助解碼遺傳變化的許多細胞效應。

  在這項新成果中,研究人員將該方法擴大到整個基因組。他們使用人類血液癌細胞系以及來自視網膜的非癌細胞,對超過250萬個細胞進行了Perturb-seq測序,並使用這些數據構建了一個將基因型與表型聯繫起來的綜合圖譜。

  挖掘未知功能 


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