1978年，20歲的朱之文進入廈門大學經濟系學習，與國家發展和改革委員會黨組副書記、副主任何立峰，廈大現任校長朱崇實均為同系同級的同學。
畢業後，朱之文留校任教。先後任廈門大學團委副書記，國際貿易系黨總支副書記、書記，廈門大學黨辦主任，校長助理，副校長。
2000年3月，在廈大工作18年後，朱之文被調往福州，任福建省教育廳黨組書記、廳長，直到2005年。
2006年10月，朱之文重新回到廈大，任廈門大學黨委書記。“我曾在廈大學習工作過20年，廈大是我母校，是教育我培養我成長的地方，我很榮幸有機會再次為母校服務。”朱之文在回到廈大的次年表示。
據廈門大學一位經濟學副教授向時代周報記者回憶，剛剛回到廈大的朱之文馬上面臨一個問題：廈大教師待遇不高，甚至低於同處廈門的兩所本地二本院校：集美大學和廈門理工學院。
朱之文很快開始跑北京，先前往教育部，再去財政部，多方努力之後，終於得到了一筆可以按年度持續用於改善教師待遇的費用。因此廈大教師們對於已經離開多年的朱之文，都印象頗佳。
在校區擴展上，朱之文亦作出努力和開拓。
廈大本部處於狹小的廈門島東南端，校園占地面積偏小。2007年8月，廈門市政府與廈大簽訂戰略合作框架協議，雙方決定在廈門位於城郊翔安區建設一個比廈大本部更大的廈大新校區，占地總面積3645畝、總建築面積115萬平方米、總投資36億元。
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