文部省還特別對安全工作提出明確要求：學校須事先派人對旅行路線進行踩點；出行前務必做好學生的道德指導和安全教育工作；要有校領導帶隊，並配備足夠數量的教師和醫務人員，事先做好避難、救護等各種應急預案；旅行結束後對每個環節進行總結評價。
對於組織學生去國外修學旅行的情況，文部省要求學校要通過地方政府事先向外務省了解擬訪問國家的安全、衛生等情況，並提前將人員名單和日程通知駐外使領館，以備發生突發事件時及時得到使領館的保護和救助。
目前，日本47個都道府縣（省級行政區）及政令都市（相當於計劃單列市）的教育委員會都根據文部科學省的有關要求制定了《修學旅行實施基準》，並對修學旅行的實施目標、出行路線、活動內容和日程、帶隊人員組成、學生組織管理、住宿餐飲條件和環境、旅費支出、健康和應急管理體制、旅行保險、旅行社資質等進行全面審核。
另外，為達到教育公平和可持續的目的，地方政府還對公立學校中的困難家庭學生提供旅費補助。由政府開辦的博物館等公共文化設施一般會免費向修學旅行的學生開放，地方政府也會出面組織學校與鐵路公司等公共交通企業及有關民營文化設施交涉，為學生爭取價格優惠。
從費用上看，在日本國內進行修學旅行的費用，小學生一般不超過5萬日元，初中生平均6.5萬日元，高中生平均7.5萬日元，去國外旅行一般要10萬日元左右，最多不超過15萬日元。而中央政府除在政策上大力鼓勵外，出於對地方旅遊經濟的支持，有時也會對學生修學旅行提供經費支持。
從風險應對方面來看，由於日本社會對中小學生修學旅行早已形成廣泛的共識，加上有成熟可靠的社會保障體系，因此即使在修學旅行中發生人身傷亡等意外事故，只要學校在組織過程中沒有明顯的過失，社會輿論和學生家長一般都會理性對待，由學校與家長通過協商或法律手段解決
3.合理安排 一舉多得 |
