一般而言，“宙斯盾”艦是航母編隊的標配，用於增強艦隊編隊的防空能力，保證航母在現代戰爭中的存活率。那麼，如果一艘“宙斯盾”艦單打獨鬥，它有什麼弱點？
第一，相控陣雷達的優點有時候也會變成缺點。這種雷達特別敏銳，有時候過度敏銳，容易“一驚一乍”，把不是威脅的目標也當成打擊對象，白白浪費彈藥。
第二，與防空能力相比，“宙斯盾”艦的反潛能力相對較弱。當然，這並不意味著“宙斯盾”艦沒有探測潛水艇的聲呐設備，而是由於這種軍艦偏向於防空，因而沒有配備足夠的反潛武器。因此，即便偵測到潛艇，也無法有效發動攻擊。另外，“阿利·伯克”級排水量大，機動性相對差一些，因此躲閃魚雷的能力不足，容易成為潛艇攻擊的目標。
第三，任何先進的系統也有極限，“宙斯盾”也不例外。依據一些機構2008年的測算數據，通常情況下，“宙斯盾”系統同時最多只能應付12枚反艦導彈。如果採取“飽和”攻擊，即同時發射12枚以上反艦導彈攻擊單獨一艘“宙斯盾”艦，那麼“宙斯盾”系統也無暇顧及。有分析人士認為，即便當前“宙斯盾”系統升級後處理能力更加強大，也無法遠遠超過12枚這一界限。
第四，抵擋全制式攻擊有困難。打個比方，兩名拳擊手比賽，如果一方僅僅使用直拳攻擊，另一方防守起來就比較容易。如果刺拳、直拳、勾拳、擺拳齊出，另一方的防禦就容易出漏洞。對付“宙斯盾”艦也是相同的道理，如果只有一種制式的反艦導彈，“宙斯盾”系統應對起來就游刃有餘，但如果面對高速、中速、低速、遠程、中程、近程的全方位打擊，“宙斯盾”極有可能就會成為“死盾”。
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