“這種探針很細，對細胞的損傷很小，就像魚鈎一樣，改造後可以把細胞中的RNA‘釣’出來，並能保證細胞繼續存活。我們改造了數十個探針後，結果只在兩個細胞上成功‘釣’到了RNA。”陳萬澤回憶道，當時購買一個原子力顯微鏡探針需要800美元，研究成本太高，成功率太低，這種情況讓這項研究再次面臨阻礙。
在一次偶然的學術交流中，陳萬澤與導師瞭解到，瑞士蘇黎世聯邦理工學院的朱麗亞·沃爾特（Julia Vorholt）實驗室開發了一種特殊的原子力顯微鏡，能夠吸出一部分細胞質。
一番交流後，陳萬澤團隊與朱麗亞·沃爾特實驗室一拍即合，展開了聯合攻關。聯合團隊對一系列的實驗過程進行了優化，解決了RNA降解、低溫下的快速操作、超微量樣品轉移、采樣通道清洗避免交叉污染、圖像下追蹤細胞等多個問題，保證了實驗結果的可靠性。
聯合團隊利用重新改造後的活細胞轉錄組測序技術，對5種類型共295個細胞進行了測序，發現該技術能夠有效區分不同類型的細胞，且平均每個細胞能檢測到約4112個基因的表達信息。
僅對少量的細胞質進行測序，是否就能代表細胞的狀態？
“我們平行比較了單細胞轉錄組測序結果，發現活細胞轉錄組測序結果與普通的單細胞轉錄組測序結果高度吻合，證明活細胞轉錄組測序技術能夠很好地體現細胞的全轉錄組狀態。”陳萬澤說道。
細胞的存活率又如何保證呢？
“這種特殊的原子力顯微鏡探針尖端祗有幾百個納米大小，對細胞損傷極小。吸取約5%—50%的細胞質後，細胞體積可以快速恢復到正常水平，存活率為85%—89%，細胞能進行正常分裂。通過一系列的功能分析和分子表征，我們沒有發現活細胞轉錄組測序技術對細胞的狀態有顯著的影響。”陳萬澤表示。 |
