陳立夫的提案及一系列談話，對國民黨長期堅持的“三不”政策是一個有力的衝擊，國民黨當局既對他不滿，但又無可奈何，最後武斷地否決了他們的提案。這對陳立夫無疑是個沉重的打擊，他一下子陷入迷茫之中。他不理解台灣當局為什麼如此頑固，他在信中深為惋惜地說：“我與趙耀東同志，連同中央評議委員32 人，提案以中國文化建立兩岸之共信，並以美金100億元與大陸共同開始建設國父實業計劃之一部分，藉以建立互信，進而達致兩岸之和平統一，此案通過中央評議會議，此一構想有勝於三民義統一中國之號召，中共方面有反應贊成，但吾政府方面，似怕蔣經國之乏誠意，未有進行”，儘管“海內外各方對之反應雖佳，此案仍不免胎死腹中，殊為可惜”。中國文化統一論的提出，以及陳立夫諸多有關統一的言論，奠定了他在海峽兩岸關係上的特殊地位，台灣媒體尊之為“促進兩岸交流與和平”的“基磐”，他還當選為“海峽兩岸和平統一促進會”的名譽會長。
1994年，陳立夫向大陸海協會會長汪道涵贈送一幅墨寶，書雲：“求統一不談小節，為和平先天至誠”，表達了他渴求祖國統一的心情。李登輝上台後，鼓吹“台獨”，對要求統一的台灣愛國人士進行打壓，不僅不尊重陳立夫等人有關統一的設想和建議，連陳立夫的“總統府資政”的頭銜也給拿掉，對此，陳立夫既感到憤懣，又感到憂慮。
1999年4月，《財訊》雜誌採訪陳立夫時提起此事。陳立夫說：“曾經有人幫我問過李總統，為什麼不讓陳立夫做資政了？他說，因為我常常在美國。其實我沒有，我去美國不超過三個月，每次都請假，回來也會銷假。”原因是什麼呢？陳立夫說：“他有時候要搞‘台獨’。”對李登輝上台後的言行，陳立夫十分不滿，他說，蔣經國逝世後，推李登輝代之，“及國大召開，一部分代表有不同意見，擬另推他人，乃有八大元老出面斡旋之舉，不料事後老國代被迫退休，二屆國代，另行產生，並主修憲，‘台獨’囂張……”當記者問如何看兩岸統一問題時，他信心十足地說：“現在是中國發展的最好時刻，美、蘇兩強都有困難，只要兩岸把真話講出來，統一蠻容易”，“我相信不要多少年，中國會世界第一”。
對於台獨，陳立夫堅決反對，他接受大陸學者陳秀惠訪問時說：“在自己漫長一生中，從小時候起就知道世界上只有一個中國，要說有什麼問題，也就是誰代表中國的正統之爭。如果台灣有人宣布世界上有＊，我想事情一定會變得相當嚴重，不但我們的文化生命會立刻緊張起來，整個民族生命也會立刻緊張起來，一定會國無寧日。”（摘自：《43位戰犯的後半生》） |
