三是作為不同政治制度的國家，兩國在包括人權、宗教等問題上存在分歧，甚至在西藏、新疆等問題上，日本輿論中對中國的負面看法還不少。
這些問題的形成，直接影響到兩國民眾的情感層面。因此，在談及中日關係時，中日雙方的學者都非常重視彼此民意的形成。這種民意的形成是多方面作用的結果，一方面是社會輿論中長期的歷史積累，它有合理的一面，也有情緒化的一面。
例如在2010年底，日本內閣做的年度性“與外交相關的輿論調查”中，受訪者中20%回答“對中國有好感”，77.4%表示“沒好感”———這一比例是1986年以來最高的。
但是與此同時，中日之間的經貿、人員往來都在不斷增加。這二者之間並沒有發生直接的正相關關係。
另一方面，民意的形成也與媒體長期報道有關。在中日關係上，兩國媒體都承擔著重要的作用。這些年來，兩國媒體關注彼此之間的衝突和突發事件，多於長期交往，也形成了輿論上的壓力。這些突發事件的報道，直接影響中日兩國民眾中的相互印象。
在21世紀初的幾年時間裡，由於小泉純一郎對華採取相對強硬的政策，並多次參拜靖國神社，在中國的輿論中日本形象有較大的下滑。而在2005年之後，由於“毒餃子”事件，中日油氣田爭端以及2010年的釣魚島撞船事件等，日本輿論對華態度也有明顯下滑。
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