1986年以來，世界上大多數國家都禁止商業捕鯨，日本一直我行我素，目前日本的小型鯨類捕殺行為，在日本國內本身確實是合法的，2006年11月雅虎日文網站的民意調查則表明，竟有90%的日本人支持重開商業捕鯨。據《日本時報》報道，2012年10月，在日本研究中心面向全國展開的一項1200人的調查中，26.8%的人認為日本應該繼續捕鯨，而只有18.5%的人表示捕鯨活動應該停止，而其餘54.7%則表示無所謂。
由於《國際捕鯨管制公約》對以科研為目的的捕鯨給與了豁免，《瀕危野生動植物種國際貿易公約》也允許科研捕鯨獲得的附錄Ⅱ所列鯨類標本的貿易。而一旦被確定是科研目的，則《生物多樣性公約》中各項義務的違反亦不存在。日本人認為， 他們的“科考”行為符合世界捕鯨委員會1986 年通過的《全球禁止捕鯨公約》， 該公約只是嚴格禁止世界各國進行商業捕鯨， 但並未禁止“ 以研究為目的”的“限量”的捕鯨活動。日本水產廳官員森下丈二就解釋說：“採用致死性取樣的主要目的是計算小須鯨的群體參數和進行攝食生態學的研究……需要通過選擇性地減少某些物種的數量來保護漁業資源，促進一些經濟價值更高的種類（如藍鯨）的恢復。曾任日本駐華大使館新聞文化中心主任的井出敬二也在接受採訪時表示，把鯨肉利用為食品投放在市場上，這和“科學捕鯨”並不矛盾。在2001年，社團法人新情報中心對國民進行的捕鯨問題調查表明，有75.5%的日本人贊成世界各國科學捕鯨，反對的只有9.9%，而對日本沿海科學捕鯨有71.9%的人表示贊同。
據日本鯨類研究所的統計數據， 日本鯨肉供給量已從上世紀90年代的1700多噸增加到2006年的5500噸。圍繞捕鯨活動， 日本已形成了頗具規模的產業和市場。捕鯨產業在日本經濟中的作用微乎其微，但對沿海地區的經濟影響卻十分重要。目前， 日本僅太平洋地區就有捕鯨船1000艘， 工人10萬， 並擁有北海道函館市、和歌山縣太地町以及山口縣下關市等六個捕鯨基地。其中，太地町是一個非常小的鄉村城鎮，沒有其他的主要產業，捕獵海豚是他們的謀生手段，許多人靠此生存。
目前日本小型鯨類捕殺行為，本身確實是合法的，也難以站在生態角度譴責，因為它們的數量並未受到捕獵的影響。在《海豚灣》這部電影中多次指責國際捕鯨委員會（IWC）不把在太地町被屠殺的寬吻海豚等小型鯨類列入禁捕名單。但寬吻海豚分布極廣，十分常見，國際自然保護聯盟（IUCN）將它列入“無危”，並估計全世界種群數量至少也有600，000只，西北太平洋約有168，000只，哪怕僅日本海岸也有4萬只，太地町的捕殺量無法造成影響。日本水產廳認為，日本近年來捕鯨的數量有所減少，為了防止濫殺，每個地方政府都會設定捕殺數量限制。對座頭鯨等較珍稀的鯨類，日本已於2007年12月21日宣布不再捕殺。
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