保持經費投入穩步增長，不斷優化投入結構。基礎研究難度大、花費高、周期長，需要持續穩定的經費支持。一方面，加大財政投入力度。既保障自由探索型基礎研究經費比例，強化國家自然科學基金等對自由探索型基礎研究的支持作用，又緊密圍繞製造強國、航天強國、交通強國、網絡強國、海洋強國等建設需求，優化國家科技計劃體系和運行機制。另一方面，引導企業和金融機構以適當形式加大支持。企業是創新的主體，適當擴大企業基礎研究稅收優惠範圍、加大執行力度，有利於激勵企業成為基礎研究投入與執行的重要主體。同時，鼓勵社會以捐贈和建立基金等方式多渠道投入基礎研究。
完善激勵評價機制，造就一流人才隊伍。加強基礎研究，歸根結底要靠高水平人才。要堅持走基礎研究人才自主培養之路，推進科教融合協同育人，源源不斷地造就規模宏大的基礎研究後備力量。制定實施基礎研究人才專項，從挑大梁、增機會、減考核、保時間、強身心等方面繼續系統施策，加強對青年科技人才培養的支持。強化以質量、績效、貢獻為核心的科技成果評價導向，完善目標導向型和自由探索型基礎研究科研項目分類評價制度。擴大國際科技交流合作，營造良好的人才創新生態，聚天下英才而用之，充分激發廣大科研人員的積極性、主動性、創造性。
處理好新型舉國體制與市場機制的關係。針對不同類型的基礎研究，加強分類施策。自由探索型基礎研究可以更多依托高水平大學和科研機構，發揮專業團隊優勢，同時適應“大科學”發展需要，發揮重大科技基礎設施作用和多學科大團隊協同攻關優勢。目標導向型基礎研究可強化有組織科研攻關，充分發揮國家戰略科技力量的優勢，在參與主體和人員的動員與激勵方面更多發揮市場機制的作用，真正實現跨區域、跨領域、跨學科協同創新，推動形成重大科學突破。
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