正是出於對南海形勢的憂慮，兩岸四地媒體、學者還有海外華人紛紛建言獻策，呼籲海峽兩岸南海合作。而建言中合作的領域從低敏感領域逐漸向高敏感領域擴展，則反映了他們對南海形勢緊迫性的認知，同時也是加強海峽兩岸南海合作已逐漸凝聚為共識的一種反映。
近兩年海峽兩岸關係的改善也是兩岸南海合作呼聲升高的原因之一。民進黨執政時期，雖然台灣當局也有修建機場、碼頭等加強太平島防禦，“宣示”主權的行為，但由於民進黨當局堅持獨立分裂的立場，加強南海軍事建設，“維護”南海權益的行徑與其擴大“國際空間”的企圖聯繫在一起，是為台獨利益服務的。因而民進黨當局的兩岸政策致使兩岸政治關係長期處於敵對狀態，自然也就不會有人呼籲兩岸南海合作，或者即使有這方面的呼籲，也不可能像目前這樣匯聚成比較大的輿論呼聲。
國民黨重新上台執政，兩岸政治關係雖然未立刻有實質性的改善，但人心、氣氛為之一振。特別是國民黨上台執政不久，就向日本強調釣魚島是“中華民國”領土，雙方軍艦還在釣魚島海域出現對峙局面。這與民進黨時期台灣當局在爭釣魚島主權問題上無所作為，不與日本力爭甚至還有民進黨人士稱釣魚島是日本的，或者稱台灣對釣魚島的主權主張與中國無關等言論都有天壤之別。
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