考慮到國外在珊瑚礁填礁造陸等方面已經有較長的時期和經驗，中國在島礁擴建施工過程中，借鑒了國外類似建設工程的施工工藝和環境保護標準。建設方分析了世界上多個國家珊瑚礁填海造陸、清淤疏浚和開挖填埋等工程，借鑒了如巴哈馬北阿巴科港（North Abaco Port）、牙買加金斯頓KCT碼頭、蘇丹薩瓦金港、巴布亞新幾內亞港等類似工程環境影響減緩措施和施工工藝等內容，並與國內相似島礁開展了類比分析工作。同時，中國的工程建設公司積極參加國外珊瑚礁填海造陸和清淤疏浚工程，在實際施工中不僅掌握了大量先進環保的施工方法，還從中積累了寶貴的經驗，為開展我國南沙島礁建設奠定了堅實的基礎。建設方嚴格環保標準進行建設：（1）盡可能減少圍填和疏浚的面積；（2）在疏浚施工和圍填過程中設置攔污屏；（3）合理安排施工進度，施工期盡量避開紅笛鯛（4月中旬）、金槍魚（高峰為6－8月）和鰹魚（3－8月）的產卵期；（4）定期監測取砂區沉積物粒級變化，以保證取砂區始終是粗砂，避免細砂進入吹填區，維持珊瑚礁水域的水質；（5）盡量在南沙群島和西沙群島珊瑚生長的高峰季節減小施工強度；根據珊瑚的生長規律和生物特點，動態監測水體的濁度變化，合理調整疏浚時間間隔；（6）定期監測施工區珊瑚礁的生長和健康水平；定期監測珊瑚礁水域的游泳動物、浮游動植物種群、數量、多樣性等指標；（7）施工人員和施工船舶產生的生活和生產污水、固體廢棄物均是集中收集後，統一到大陸海港處理；（8）施工船舶均使用年代較新的船型，確保無溢油事故發生；定期收聽天氣預報和海洋預報，提前做好應對台風和強浪等對工程水工建築物襲擊的防禦準備工作，避免引起沙石流失。總之，在施工中採取一切應對措施，確保工程疏浚對珊瑚礁生態環境的影響降到最低。
在施工結束後，將開展生態補償和珊瑚礁群落重建措施。經過多年的潛心研究和實踐，國內外科學家嘗試了多種珊瑚礁生態系統的恢復方法，設計了多種人工珊瑚礁的礁體結構，證明了只要採取有效措施，可以實現珊瑚礁群落的恢復。
4.南沙島礁擴建工程對珊瑚生態系統健康的影響評估
中國海洋行業標準《近岸海洋生態健康評價指南》（HY／T087－2005）將珊瑚礁生態系統劃分為健康、亞健康和不健康3個等級。南沙島礁的珊瑚礁已被列入亞健康等級。
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