在美軍於1995年倉惶撤出索馬里後，該國就重新陷入了軍閥混戰局面，直到世紀之交，一個名為“伊斯蘭法院聯盟”的極端組織異軍突起，迅速擊潰多路軍閥，掌握了索馬里東部和南部大片土地，並攻占首都摩加迪沙。這個“法院聯盟”的崛起歷程堪稱非洲版“塔利班”，該組織亦如塔利班一樣，並不甘心統治索馬里一國，而是繼續向埃塞俄比亞和肯尼亞滲透，揚言將所有歷史上索馬里族裔生活過的土地全囊括其中。這引起了鄰國，特別是埃塞俄比亞的不安。
終於在2006年，埃塞軍隊開進索馬里，打垮了“法院聯盟”，奪取了索馬里首都摩加迪沙和南部重鎮基斯馬尤，埃塞自身積貧積弱，這場成功的軍事行動實際上得到了美國和非洲聯盟的大力支持。埃塞軍隊在索馬里駐扎到2009年，其間這一地區經歷了許多積極的改變。一是“法院聯盟”部分成員接受了招安，放棄了恐怖活動，二是世界主要大國都對索馬里海盜活動問題高度重視，各國海軍合力解決索馬里附近水域的安全問題。三是非盟維和部隊逐漸取代埃塞俄比亞軍隊，成為索馬里安全的保護者，並加緊訓練索馬里政府軍力量。這些變化讓索馬里局勢向著穩定發展，無論是“法院聯盟”，還是索馬里海盜，都逐漸淡出了世界熱點問題領域。
然而，最近一段時間以來，索馬里局勢重新惡化。首先是天災，近幾年來，東非地區氣候受到“拉尼娜”現象打擊，包括索馬里在內的多國遭受連年乾旱，大批民眾籠罩在饑荒陰影之中，在這樣的情形下，無論是海盜還是極端組織，招兵買馬變得更容易，實力都得到加強。
其次，隨著“法院聯盟”的解體，其中負隅頑抗的強硬分子組成了新的恐怖組織“青年黨”，並先後效忠於“基地”組織和IS，這個新恐怖組織的國際知名度不斷提升。在IS空前強大之時，索馬里青年黨亦頗受鼓舞，向索馬里政府軍發動日益頻繁的襲擊；而當遭受索馬里政府軍和非盟軍隊強力還擊時，青年黨分子開始向索馬里東北部軍閥割據地區“邦特蘭”滲透。邦特蘭是目前索馬里的三大實體（南部的索馬里中央政府、西北部的“索馬里蘭共和國”和邦特蘭）之一，長期被地方軍閥統治，不受索馬里中央政府支配。邦特蘭沒有另一個割據政權索馬里蘭那樣穩定發展的經濟基礎，貧窮動蕩，成為青年黨理想的藏身之所。而青年黨進駐邦特蘭，也標誌著這個極端組織由南向北，愈發逼近索馬里北邊重要的亞丁灣-曼德海峽國際水道。
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