另一方面，農業科技水平的提升以及北方農田和水利基礎設施的不斷完善為北方糧食生產創造了更好的條件。作為中國產糧第一大省，黑龍江糧食產量近20年增長了1.6倍，糧食作物播種面積增長了70%以上；與此同時，全省農業機械總動力增長了2.6倍以上，有效灌溉面積增長超1.6倍。黑龍江省科技廳副廳長王曉滸介紹，2023年，黑龍江農業科技進步貢獻率達到70.3%，高於全國平均水平7個百分點。
在多方因素綜合作用下，“北糧南運”有力支撐了全國糧食安全，但也帶來一些挑戰。
“耕地區域分布變化導致糧食產銷不平衡狀態加劇。”自然資源部部長王廣華在此前的一篇署名文章中表示，耕地保護不但有數量底線上的約束，也有布局結構上的要求。我國“耕地資源—糧食供給—生態安全”長期處於“弱平衡”狀態。
國土“三調”顯示，2009—2019年10年間，全國耕地分布重心北移、質量下降，秦嶺—淮河一線以南耕地減少1.49億畝，占全國耕地的比例從“二調”時的41%降低到36%；位於一年三熟制、一年兩熟制地區的耕地占全國耕地的52.13%，比“二調”時降低6.81個百分點，耕地“南減北增”趨勢加劇。
此外，從全國耕地淨增加的區域分布看，70%集中在400毫米降水量以下的北方缺水地區，相當一部分要靠開採地下水進行灌溉，給北方地區水資源利用和生態保護帶來新的挑戰；從全國宜耕後備資源區域分布看，主要集中在西北、華北、東北等水熱資源不匹配的地區，在沒有外來調水工程的情況下，不適宜再大規模開發耕地。
農業專家認為，糧食問題不是單純的經濟問題，不可能只靠市場去解決。對於糧食生產和流通格局，不能僅從比較優勢和效益優先的角度分析，應綜合考量經濟安全、糧食安全、生態安全，推動全國糧食生產合理布局。
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