大陸國家海洋局海洋發展戰略研究所李明杰與付玉兩位研究員對最近才簽定的“台日漁業協定”表達了他們的看法。他們兩人首先認為，台日漁業協定的簽訂有助於台灣漁民不必再受到日本無理阻撓而得以捕魚得利，值得高興，但是他們也表達出更多的憂慮。
他們認為從總體上看，台日漁業協定是一個具有民間性質的、有關漁業資源保護與開發的臨時性安排，不具備國際法上的條約性質和效力，但是實質上台日視其為具有“官方”性質的法律文件。
協定第四條規定“本協議之所有事項或為實施而採取之措施，均不得認為影響雙方具許可權之主管機關有關海洋法諸問題之相關立場”。李明杰與付玉對此表示，從這條文字的字面理解，該協議僅是就雙方漁民在釣魚島附近海域的漁業臨時安排，協議不影響雙方各自對釣魚島“主權”的主張。協定文本上並未規定協定是否適用於釣魚島領海內，但在4月10日台灣外事部門的新聞稿中指出該協議並不適用於“釣魚台列嶼周邊12海浬”。
李明杰與付玉表示，如果在該協議執行階段，台灣漁船和執法船放棄進入釣魚島領海作業和執法，那麼協議就不能排除“以主權換漁權”、“以小利而捨大義”之嫌。
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