兩岸產業合作和兩岸產業融合發展都是建立、發展兩岸產業之間的相互關係，但在不同的發展階段，兩岸產業合作方式不同，所形成的相互關係的緊密度及其穩定性不同，兩岸產業合作的初期階段形成的相互關係相對緊密度較低，穩定性也較弱，兩岸產業之間的緊密聯繫及其穩定性是在兩岸產業合作的不斷發展和深化過程中形成的，所以可以說兩岸產業融合發展是兩岸產業合作的高級發展階段。
兩岸產業合作與兩岸產業融合發展的區別不僅是表現在兩岸產業之間相互關係的緊密度及其穩定性上，還有一個重要的方面是，兩岸產業合作在初期的發展中衹發生在個別產業、行業的相互關係上，橫向縱向的關聯度較低，屬於淺表層關聯和局部關聯，當兩岸產業合作的深度和廣度不斷發展，兩岸產業之間的關聯必然向整體性融合發展，逐漸並最終形成兩岸產業的體系性融合，即兩岸產業體系的結構性對接，實現兩岸產業體系的一體化融合，所以，兩岸產業融合是兩岸產業體系的結構性緊密關係的形成並穩定運行與發展。
因此，推動兩岸產業融合發展，必須不斷地拓展和深化兩岸產業合作，在現有產業合作的基礎上，不斷強化合作關係，使這種關係達到緊密且穩定的狀態。同時，不斷擴大兩岸產業合作的領域和接觸面，產業鏈、供應鏈和價值鏈的相互作用增強兩岸產業合作關係，增加擴大兩岸產業合作面，為兩岸產業體系的結構性對接，實現兩岸產業融合發展創造良好的條件。
二、推動兩岸產業合作的緊密度不斷提高
（一）推動兩岸產業合作轉型升級
兩岸產業合作始於兩岸貿易，即通過商品貿易建立兩岸產業之間的相互關係。這個階段的兩岸產業合作比較簡單、零散，主要是最終消費品的互補性交易，規模小，結構單一，受市場等短期因素影響較大，因而穩定性也比較差。隨著台商對大陸投資的不斷發展，台商投資成為兩岸產業合作的主要推動力和重要形式，開始以嵌入大陸經濟的方式展開兩岸產業合作。
以台商對大陸投資的形式展開的兩岸產業合作也經歷了不同的發展階段。早期的台商對大陸投資是以向大陸轉移傳統產業為主要內容，借助大陸的土地、勞動力等要素資源優勢，借道出海，推動了兩岸產業合作的規模和深度的發展，其中包括投資帶動台灣對大陸的出口迅速擴大，尤其是大量的機器設備、原輔材料和零組件的輸出，形成了投資帶動貿易的態勢，也建立起兩岸產業的供應鏈合作關係，這是相對於單純貿易階段的產業合作的重要發展，兩岸產業之間的相互關係較之前更為緊密，穩定性大大提升。 |
