隨著兩岸經濟發展水平和產業發展水平的提升，兩岸之間不但可以也應該在較高的發展水平上進行產業合作，實現“強強聯合”。隨著兩岸經濟水平的提升，兩岸都高度重視新興產業的發展，兩岸在新興產業的發展中有許多交集，互有比較優勢，如果能夠展開合作，不但能夠加快新興產業的發展步伐，還有希望形成國際市場競爭優勢，提升兩岸產業在國際分工中的地位，這樣的產業合作關係必然是高度緊密的，有助於推動兩岸產業供應鏈、價值鏈關係的增強與發展。
第三，探索開展價值增值型合作，即從成本節約型合作為主向以提升附加價值型合作為主轉變。
台商對大陸投資的早期主要是利用大陸的土地、勞動力要素資源條件，降低成本以保持國際市場競爭力，隨後出現的上游產業跟進到大陸投資，也是產業供應鏈關係通過靠近廠商的方式節約成本，這樣的兩岸產業合作主要集中在生產環節，在國際分工中處於中低端地位。隨著兩岸產業經濟水平的發展，通過兩岸產業合作，完全有可能，也有必要在成本節約型合作的基礎上向增值型合作轉變，即兩岸相關企業加強在研發、品牌、行銷通路、客戶服務等方面進行全面深入合作，充分利用大陸市場潛力和相對完整的工業體系優勢，將供應鏈合作延伸擴展到價值鏈合作，提升兩岸產業在國際分工中的地位。
（二）提高兩岸產業合作的組織度
兩岸產業合作的實現必須依托市場機制實現，但市場媒介的不穩定性對於兩岸產業合作關係的強化和穩定會產生消極的影響作用，對此，可以通過提高兩岸產業合作的組織度來提高和保證兩岸產業合作關係的緊密度和穩定性。
第一，鼓勵兩岸企業在產業合作中合作投資。合作投資是建立緊密合作關係的重要且有效的形式，是通過資本的融合以企業組織形式把產業合作關係固化，形成具有高度的穩定性和緊密性的產業合作關係。現有在大陸的台資企業，基本屬於“單打獨鬥”的狀態，兩岸企業合作投資的案例極少。在繼續吸引台商對大陸投資的同時，鼓勵台商投資與大陸產業銜接性強的項目，與大陸企業合作投資，舉辦合資企業；鼓勵台資企業參與大陸企業（包括國有企業）的改組、重組，有利於把兩岸的產業合作置於特定的產業組織關係和組織形式之中，加強兩岸產業合作的緊密度及其穩定性。 |
